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辽宁中医药大学附属第二医院中医药循证能力建设项目(眼科专项))竞争性谈判公告
辽宁中医药大学附属第二医院中医药循证 正文内容
辽宁中医药大学附属第二医院中医药循证能力建设项目(眼科专项))竞争性谈判公告
辽宁中医药大学附属第二医院中医药循证能力建设项目(眼科专项))竞争性谈判公告
项目概况
辽宁中医药大学附属第二医院中医药循证能力建设项目(眼科专项)采购项目的潜在供应商应获取采购文件,并于2021年01月19日 09时30分(北京时间)前提交响应文件。
一、项目基本情况
项目编号:JH20-210000-95247
项目名称:辽宁中医药大学附属第二医院中医药循证能力建设项目(眼科专项)
采购方式:竞争性谈判
包组编号:001
预算金额(元):300,000.00
最高限价(元):300,000.00
采购需求:查看
一.总体要求
1.1总体要求
1.1.1为保证数据安全,数据本地化存储,需采用私有云架构,部署在医院数据中心机房。
1.1.2应用架构的设计要求能够支撑大规模的数据量,基于Hadoop大数据的分析架构模型,支持B/S浏览器架构。
1.1.3平台提供基于容器的微服务架构Kubernetes(k8s)等,提供灵活、高效的应用开发、部署、运维能力。
1.1.4大数据应用集群可以运用Ceph虚拟化技术进一步增强存储、计算、网络资源的灵活性、可靠性、隔离性和可管理性。
1.1.5具有抽象统一的底层医学数据模型,支持按照疾病领域加工数据建立模型。
1.1.6具有良好的安全机制完成用户的认证、授权和数据加密方案。
1.1.7通过部署大数据计算框架,基于多种算法库,实现大数据存储访问及分布式计算任务调度、多维索引数据的深度搜索等功能。
1.1.8建立基于分布式并行计算架构,部署服务器集群,具备横向扩展能力,可以动态增加或减少计算资源和存储资源,支持 PB 量级离线计算和在线计算。
1.1.9支持各种类型文件推送: tsv,csv, excel等。
1.1.10离线计算支持基于CDH的Hadoop集群,HDFS数据存储,MapReduce和Spark计算等,对海量数据进行分析。
1.1.11在线计算支持Presto技术,对固定报表提供秒级别的查询响应;支持SparkStreaming和Flink,对海量大数据支持实时计算和处理。
1.1.12充分发挥SQL和MongoDB不同类型数据库的特性,提升产品性能和用户响应速度,支持存储比较复杂的数据类型。
1.1.13提供基于Lucene的ElasticSearch等分布式搜索引擎技术,实现数据的快速查询及调阅,并可支持不同平台的应用。
1.2数据清洗
对采集汇聚的数据进行清洗加工处理,并做标准化整理。主要包括制定数据清洗流程、清洗流程控制、清洗质量控制、清洗过程管理等。通过规范流程和规则库,基于流程引擎构建统一的、可配置的数据转换、清洗、比对、关联、融合等加工处理过程,对异构异源海量离散的数据资源加工生产,生成易于分析利用的、可共享的数据。
1.3数据标准化
平台参考以下国内、国际、行业、指南等标准(包括但不限于),对采集数据进行标准化处理,并反馈给业务系统:
1.3.1卫健委数据标准:中国卫生信息数据元值域代码WS364.X-2011、电子病历基本数据集WS445.X-2014、医疗机构诊疗科目名录、中国卫生信息数据元、电子病历基本数据集。
1.3.2 国家相关数据标准:GB/T 2261.1-2003 个人基本信息分类与代码、GB/T 4671-2008 家庭关系代码。
1.3.3相关术语标准:国际疾病分类第九版临床修订第三卷:手术与操作 ICD-9-CM-3、国际疾病分类第10版 ICD-10、国际疾病分类肿瘤学专辑第三版 ICD-O-3 、观测指标标识符逻辑命名与编码系统LOINC V2.42、SNOMED CT、MESH。
1.3.4肿瘤学国际诊治指南:AJCC/UICC临床分期手册(第7版)、美国国家癌症研究所常见不良事件评价标准第四版CTCAE V4、美国国家癌症研究所肿瘤放疗小组远期放疗反应评估表、实体肿瘤疗效评估标准(RECIST) V1.1(美国,英国,加拿大,欧洲等)。
1.3.5国际性肿瘤数据库结构:美国国家癌症研究所(NCI)SEER计划编码和分期手册2015版、美国外科医生学院机构肿瘤注册数据标准FORDS2015版、英国国家癌症智能网络国家癌症数据储存库数据定义NCDRR_V5.2、美国肿瘤临床协会(ASCO)治疗计划最终版(Online)、英国国家临床分析与特定应用小组(NCASAT)放疗数据集RTDS数据手册及实施指导V4.0.8。
1.3.6 HL7CDA文档:HL7ChinaCDA规范试行2013版
1.3.7药品词典规范:CFDA,ATC分类。
1.4自然语言处理技术要求
1.4.1自然语言处理引擎需结合NLP技术、医学术语库、医学知识图谱、深度学习技术、图像识别等前沿技术,可以对临床自由文本数据进行语义解析与后结构化处理,可以将数据处理为key-value形式的数据;可以持续处理接入到系统中的临床文本数据和胸部影像数据。结构化后的数据,需要包含人口学信息、重点疾病确诊信息、疾病相关因素信息、就诊症状与诊断信息、实验室检验信息、病理、手术、化疗、医嘱用药模块。
1.4.2支持文本分句、分词能力 支持自然语言分词能力;分词使用的医学专业词库种类多样。
1.4.3支持关键术语提取与医学术语本体构建技术 需使用深度学习技术,对医学自然语言实现语义解析和结构化提取;结合自建中文医学术语与中文医学知识图谱,在解析文本语义的基础上,识别并构建医学术语本体,支撑后续信息逻辑抽取与信息网络架构。
1.4.4支持自然语言识别建模与文本结构化 支持基于医学术语本体构建以及进一步文本信息逻辑抽取与网络架构搭建的结果,进行自然语言识别建模,全面解析自然语言文本中的全量信息,建立语义解析模型。并在语义模型的基础上,有效提取疾病相关关键信息,进行语义推导与结构化输出;结构化模型可以在医院的临床数据中进行持续的训练,不断地提升准确率。
1.4.5支持文本标准化处理与输出 自然语言结构化提取结果,需可以参照医学术语标准或医学知识图谱进行表述的标准化和归一;
1.4.6支持BERT、ELMo、PointerNet、Bi-LSTM、Transformer、CRF等前沿技术进行自然语言处理。
1.4.7影像学报告解析
能够支持对CT、MR、PET-CT等重点疾病诊断和疗效评估相关的影像学检查报告进行全量信息的结构化表达。
1.4.8支持病理报告解析:能够对重点疾病相关病理报告进行全量信息解析
1.4.9支持手术信息等的解析、提取、标准化。
1.4.10支持提取诊断、实验室检验、药品等结构化临床信息,并参照相关数据标准进行标准化归一。
1.4.11治疗方案的识别与结构化,能够基于自然语言处理技术和医学知识图谱技术,使用出院小结、医嘱等数据对患者的治疗方案进行归类总结和结构化表达。
1.4.12基于自动摘要实现病情总结,能够基于自然语言处理中的段落摘要技术,对现病史、出院小结报告等信息,对患者的首次确诊的时间和方式、病理诊断的分期分型、基因诊断进行总结和结构化表达。
1.5医学术语库要求
1.5.1搭建完善的医学术语与术语关系图谱,支撑医学文本全量信息解析。
1.5.2医学术语库需要可扩充易维护。拥有完整、结构合理的自建中文医学术语库,中文概念及中文描述 支持全球范围内领先的医学知识图谱作为自然语言处理的语义解析基础,包括SNOMED-CT、UMLS、MeSH或类似架构的中文医学知识图谱;使用的医学知识图谱可以编辑更新,持续提升医学自然语言处理的准确率
1.6医学影像对接要求
1.6.1 支持对接提取OCT眼底图像,可在专病库中查看相关影像
1.7数据对接要求
平台通过数据库同步技术和ETL等技术,对数据进行抽取、同步、汇集,实现针对医院多源异构数据的采集和汇聚。在不进行任何接口改造,不影响现有生产系统的情况下,平台需要整合的系统可包含医院CDR或HIS系统、EMR系统、PACS、RIS系统、检验信息系统、超声信息管理系统、病理等临床系统,实现对既往院内各系统患者数据的访问、筛选、提取患者既往诊疗相关数据,支持历史数据沉淀和复用,支持回顾性研究。平台可以随时整合新的数据源进入,不影响业务系统的使用。
平台接入内容包括但不限于下列系统及系统中的信息:
1.7.1医院CDR。
1.7.2医疗机构信息系统(HIS):患者、挂号、入出转、就诊、处方/医嘱、申请、收费三测单等信息。
1.7.3实验室系统(LIS):标本、检验结果等信息。
1.7.4超声信息系统:超声检查、超声报告等信息。
1.7.5病理信息系统:病理检查、病理标本、病理报告等信息
1.7.6内镜信息系统:内镜检查、内镜报告等信息。
1.7.7放射信息系统:放射检查、放射报告等信息。
1.7.8心电信息系统:心电检查、心电报告等信息。
1.7.9电子病历系统(EMR):入院记录、出院记录、病程等病历信息。
1.7.10护理系统:护理记录、观察记录、护理文书、用药记录等信息。
1.7.11病案管理系统:病案首页信息。
1.7.12重症监护系统:重症护理记录、观察记录、护理文书、用药记录等信息。
1.7.13手术麻醉系统:手术记录、事件、用药等信息。
1.8平台能力
操作响应时间:用户登录系统时间小于5秒;用户点击功能菜单,显示相应页面时间小于3秒;搜索引擎支持PB级别的数据2秒内响应;初始硬件配置默认支持每应用100个以上的用户并发使用。
数据容量:平台支持用户账号数量最高可不少于3000个;系统可存储患者数据总量满足实际工作需要以及未来发展规划;系统在容量、性能、用户数量、并发量等方面,不仅可以支持历史15年数据的需求,同时可以满足未来5年的业务数据增长需求;采用负载均衡等模式,使得应用性随着硬件配置的提升弹性可扩展;系统能够支持7*24小时服务。
2.专病库建设
★2.1数据驾驶舱(提供软件功能截图并加盖公章)
2.1.1数据概览,展示库内总体和各个模块分布统计,包括患者总数,就诊人次数据、时间范围等信息。
2.1.2疾病相关统计,疾病相关信息统计,包括患者基本信息、临床信息以及治疗信息的统计分布。
2.1.3平台使用情况统计,包括不同用户的访问热度统计分布。
2.1.4库内患者量走势,支持查看库内数据更新发生的患者数量走势。
2.1.5自定义展示信息,支持不同的按账号自定义展示驾驶舱上的数据信息。
2.2患者搜索
2.2.1原文搜索,支持对原文使用关键词进行搜索;支持查看搜索到的患者数据和列表信息。
★2.2.2条件树搜索,支持以树状形式添加1个以上得筛选条件,支持多层逻辑关系或非的嵌套组合,支持纳入、排除和各项之间的的灵活切换。(提供软件功能截图并加盖公章)
2.2.3事件搜索,支持“事件-时间”式筛选(例如首次病理确诊后一个月内使用了某种新辅助治疗药物)。
2.2.4患者号精确搜索,支持使用患者号进行精确搜索,支持患者号进行批量搜索,并支持查看搜索结果。
2.2.5查看搜索结果的患者列表,支持查看搜索结果的列表,包括患者的基本信息和关键疾病信息;支持对患者列表进行排序。
2.2.6重点指标分析,支持对筛选结果的患者,展示默认的关键疾病信息的统计分布,支持用户自定义查看不同字段的描述性统计分析。
2.2.7患者数据导出,支持对筛选结果做数据的表单导出。
2.2.8筛选记录和筛选收藏夹,支持记录筛选记录查看。支持保存常用的筛选条件收藏。
2.3患者全景
2.3.1患者360详情,支持查看患者的全部诊疗路径数据;支持用户自定义并查看检验指标的时序变化图;支持查看患者的全部原始数据。
★2.3.2患者时间轴,以时间轴形式查看患者的诊疗数据,并支持自定义展示配置,支持拖动和点选来查看诊疗细节。(提供软件功能截图并加盖公章)
2.3.3患者病案夹,按时间顺序展示患者每份病案摘要,并可以查看病案详情。
2.3.4结构化数据溯源,支持点击结构化数据,查看所有的数据的提取源;支持所有数据一键溯源取值逻辑,并且定位到原文。
2.4项目管理
2.4.1项目信息管理,支持对项目的增删改和项目列表查看,支持查看所有项目的概要信息,支持按照项目名称进行搜索。
2.4.2研究指标规则制备,支持对观测变量设置阶段和降维规则用于降维;支持设置自定义指标的默认规则,比如默认值、备选值等。
2.4.3研究队列管理,支持增删改队列中的患者,支持队列中的患者做搜索,支持调整队列的系统筛选条件,或手动添加患者入队列。
2.4.4数据审核,支持对课题内的结构化数据,对照原文进行细节查看和修改。
2.4.5表单导出,支持表单格式导出,并支持导出效果的在线预览,导出的excel将会按照模块区分sheet。
2.4.6宽表导出,支持宽表导出,根据基线时间,将数据拍平为一个患者一行数据,满足SPSS格式要求,并支持导出效果的在线预览。
2.4.8导出申请,导出申请与审批,根据用户的数据权限,普通科研用户导出数据时需经过线上审批,保证数据使用安全性,导出数据可进行多次下载。
2.4.9增量更新,科研项目内的增量更新数据,支持对前瞻和回顾的科研项目,患者数据发生增量更新后,提醒并支持用户确认该患者是否要入组。
2.5CRF管理
2.5.1 CRF模板管理,支持用户保存当前CRF为模板功能;支持其他项目复用CRF模板。
2.5.2 CRF表单自动填充,支持CRF表单智能预填充,效率高、减少转抄带来的人工错误。
2.5.3自定义配置CRF表(CRF编辑器),支持用户个性化制定表单,题型包括单选题、多选题、日期题、多行文本等,支持设置题目间隐藏和显示逻辑、以及自动计算逻辑。支持使用专病库的标准数据集字段作为CRF信息。
2.5.4CRF常用字典,提供CRF常用字段字典,可在表单配置中直接从字典中选取,提升eCRF搭建速度。
2.6患者随访
2.6.1随访管理,支持按照项目来灵活创建随访,并支持对随访的信息进行增删改。并支持对随访进度的可视化管理,支持随访系统中的数据统计,包括但不限于用户随访成功率,失访率,生存率;随访脱落率等数据可视化内容。
2.6.2随访计划和日历,支持对不同批次患者提供相应的随访计划和规则,可灵活设定随访频次、开始时间、结束时间、终止规则等,提供了每日的随访工作安排,可以快速开展随访数据录入工作。
2.7统计分析
2.7.1填充率计算,支持从患者维度和就诊维度统计指标的有效值数量、总数量以及填充率。
2.7.2描述性统计,支持自定义选择科研项目中的多个指标,做统计量多种维度计算,包括正态分布和方差齐性校验以及多种统计图的展示;支持所有统计指标的有效填充率自动计算。
2.7.3单因素分析,支持单变量的单因素组间比较,支持t检验、矫正t检验、秩和检验、单因素方差分析、Fisher精确概率法等统计学检验方法。
2.7.4多因素分析,支持构建回归模型,支持支持逻辑和线性回归方法。
2.7.5生存分析,支持展示生存曲线,单因素的生存分析方法log-Rank,和构建生存cox模型。
2.7.6统计结果一键生成,数据自动统计,一键生成图文报告,可直接用于论文撰写完成科研链路闭环。
2.8平台管理
2.8.1筛选记录查看,查看用户筛选记录,提供平台上所有用户的所有筛选记录,包括筛选时间、账号名、所属科室、筛选条件,并支持按照时间筛选。
2.8.2导出记录查看,用户导出记录,提供平台上所有用户的所有数据导出记录,包括导出时间、账号名、项目、导出字段。
2.8.3项目情况查看,科研项目记录,可以看到所有创建的项目,对应的创建时间、课题名称、创建人、项目成员、项目中患者数、数据被导出的次数
2.8.4审批管理,审批管理,管理员可对平台上所有用户申请的数据导出请求进行审批,在“审批”菜单栏,可通过或拒绝,拒绝时需要填写拒绝原因。
2.8.5权限管理,数据检索权限管理,可按角色分配数据检索权限,相关账号只可在权限范围内进行患者筛选,数据导出权限管理,可为账号设置“导出是否需要审批”。
2.8.6账号管理,支持增删改账号信息,支持预设管理员账号,对系统内的账号信息做角色和管理授权。
2.9个人管理
2.9.1患者收藏夹,对于感兴趣的典型患者,可加入“收藏夹”,进行反复浏览,并且可将特定患者导入特定的项目组
2.9.2操作记录查看,操作记录,查看历史的筛选操作记录,在数据筛选页面中,可以对历史的筛选条件做恢复。在导出页面,可以支持反复下载历史导出的文件。
2.9.3个人信息查看,系统需设有自有账号、密码等修改,对个人权限和信息的查看功能。
★3.1供应商在成交后应向采购人提供以下完整技术资料(中文):
(1)使用说明书
(2)操作手册
合同履行期限:合同签订后150天内
需落实的政府采购政策内容:小微企业/监狱企业/残疾人福利性单位/节能产品、环境标志产品/列入《辽宁省创新产品和服务目录》内的产品、服务
本项目(是/否)接受联合体投标:否
二、供应商的资格要求
1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定。
2.落实政府采购政策需满足的资格要求:无
3.本项目的特定资格要求:无
三、获取采购文件
时间:2021年01月08日至2021年01月13日,每天上午8时30分至11时30分,下午13时00分至16时00分(北京时间,法定节假日除外)
联系人:郝亮(经理)
电话:010-58977952
手机:13146799092
传真:010-58977952
邮箱:1094372637@qq.com
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